1936 жылы Škoda өз еліндегі автокөлік өндірушілері арасында бірінші орында болады, басқа елдерден де оң пікірлер түседі. Екінші дүниежүзілік соғыс пен оккупацияның басталуымен өндіріс Германияның қажеттіліктеріне бағытталды. Соғыс аяқталуға таяғанда, зауыт бомбаланды.
Монте-Карло раллиінде Škoda Popular Sport автокөлігімен екінші орынды иеленеді, кейінірек автокөлік атауы Monte Carlo болып өзгертіледі. Popular сонымен қатар Африкада, Балқанда және Уругвайда өткен жарыстарда жеңіске жетеді. Автокөліктердің ассортименті орта кластағы Škoda Favorit моделімен толықтырылады.
Нарыққа Škoda Popular 995 шығады. Бұл «халық Škoda-сы» (чех тілінде – «Škoda pro lid») Liduška деген лақап атқа ие болды, ол lidový (халық) сөзінен шыққан әйел есімі. Азаматтық өндіріс Екінші дүниежүзілік соғыстың басталуымен тоқтайды. Енді бүкіл кәсіпорын Reichswerke Hermann Göring AG компаниясының басқаруына өтеді.
Автокөлік өнеркәсібі әскери рельстерге ауыстырылады. Қару-жарақ компоненттеріне қоса, негізінен әртүрлі жүк көліктері, толық жетекті автокөліктер және RSO ауыр жүк көліктері шығарылады.
Млада-Болеславтағы қатты зақымдалған зауыт алғашқы жаңартылған Škoda Popular автокөліктерін шығара бастады. Ел экономикасы социалистік режимнің бақылауына өтеді. 1945 жылдың көктемінде ірі кәсіпорындар, соның ішінде Пльзеньдегі Škoda және Млада-Болеславтағы ASAP зауыттары ұлттандырылды.